Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ppargc1bQ8VHJ7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms