Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fyco1Q8VDC1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fyco1Q8VDC1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms