Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alg12Q8VDB2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alg12Q8VDB2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms