Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d2Q8VD57 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms