Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms