Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ApobrQ8VBT6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ApobrQ8VBT6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms