Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Top1mtQ8R4U6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Top1mtQ8R4U6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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