Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup35Q8R4R6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup35Q8R4R6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms