Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
0610009B22RikQ8R3W2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms