Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms