Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q7

Cerk, Ceramide kinase, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerkQ8K4Q7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CerkQ8K4Q7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CerkQ8K4Q7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CerkQ8K4Q7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CerkQ8K4Q7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CerkQ8K4Q7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms