Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pof1bQ8K4L4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pof1bQ8K4L4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms