Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OptnQ8K3K8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OptnQ8K3K8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms