Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssh3Q8K330 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms