Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf13Q8K2W6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf13Q8K2W6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms