Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcf3Q8K268 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcf3Q8K268 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms