Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfip2Q8K221 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms