Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx5Q8K1E0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx5Q8K1E0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx5Q8K1E0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx5Q8K1E0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx5Q8K1E0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx5Q8K1E0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx5Q8K1E0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx5Q8K1E0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx5Q8K1E0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx5Q8K1E0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx5Q8K1E0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms