Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms