Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Afg3l2Q8JZQ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms