Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SbsnQ8CIT9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsnQ8CIT9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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