Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nupl2Q8CIC2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms