Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tph2Q8CGV2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tph2Q8CGV2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms