Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snx8Q8CFD4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx8Q8CFD4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms