Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms