Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap2Q8C1B1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap2Q8C1B1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms