Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l1Q8C0J2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms