Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Usp38Q8BW70 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Usp38Q8BW70 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Usp38Q8BW70 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Usp38Q8BW70 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp38Q8BW70 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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