Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy1Q8BIJ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms