Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIA3

Mkx, Homeobox protein Mohawk, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkxQ8BIA3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MkxQ8BIA3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MkxQ8BIA3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms