Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHL4

Gprc5a, Retinoic acid-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprc5aQ8BHL4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gprc5aQ8BHL4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gprc5aQ8BHL4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms