Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubash3bQ8BGG7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ubash3bQ8BGG7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubash3bQ8BGG7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubash3bQ8BGG7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubash3bQ8BGG7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubash3bQ8BGG7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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