Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms