Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ClspnQ80YR7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ClspnQ80YR7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms