Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ell3Q80VR2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms