Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sestd1Q80UK0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sestd1Q80UK0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms