Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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RubcnQ80U62 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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RubcnQ80U62 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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RubcnQ80U62 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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RubcnQ80U62 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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RubcnQ80U62 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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RubcnQ80U62 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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RubcnQ80U62 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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RubcnQ80U62 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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RubcnQ80U62 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
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RubcnQ80U62 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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RubcnQ80U62 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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RubcnQ80U62 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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RubcnQ80U62 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnQ80U62 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms