Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf18Q7TS55 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf18Q7TS55 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms