Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms