Protein–RNA interactions for Protein: Q791N7

Znrd1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrd1Q791N7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znrd1Q791N7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrd1Q791N7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms