Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GypcQ78HU7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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