Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms