Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup188Q6ZQH8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms