Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.32■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.32■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March6Q6ZQ89 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
March6Q6ZQ89 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms