Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Efr3bQ6ZQ18 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Efr3bQ6ZQ18 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Efr3bQ6ZQ18 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Efr3bQ6ZQ18 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Efr3bQ6ZQ18 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Efr3bQ6ZQ18 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Efr3bQ6ZQ18 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Efr3bQ6ZQ18 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Efr3bQ6ZQ18 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms