Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja6Q6S5G4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gja6Q6S5G4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gja6Q6S5G4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gja6Q6S5G4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gja6Q6S5G4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja6Q6S5G4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja6Q6S5G4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja6Q6S5G4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja6Q6S5G4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms