Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc154Q6RUT8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc154Q6RUT8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms