Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT7

Ccsmst1, Protein CCSMST1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsmst1Q6RUT7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccsmst1Q6RUT7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccsmst1Q6RUT7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms