Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms