Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx13Q6PHS6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx13Q6PHS6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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